Po vjeroispovjesti, Kotorani su 30% katolici, a 70% pravoslavne vjeroispovjesti. U starom gradu postoje 2 pravoslavne i 6 katolickih crkvi. Pretpostavlja se da su prvi stanovnici Kotora bili katolici, sto je i razumljivo, s obzirom da su rimljani prvi naselili podrucje danasnjeg Kotora. Pravoslavci se naseljavaju malo kasnije.
CRKVA SVETI LUKA je najstarija kotorska pravoslavna crkva. Nalazi se na pravoslavnom trgu i podignuta je 1195. godine, za vrijeme vladavine srpske dinastije Nemanjići. Crkva je građena u romanskom stilu, a prema sacuvanom ktitorskom natpisu na crkvi, podigao ju je Mauro Kazafrangi sa svojom zenom Bonom. Prvobitno je crkva svetog Luke bila katolicka crkva. U XIV vijeku u Kotoru se nastanjuju pravoslavci.
Kotorani su dosta kasno, unutar grada,dobili svoju pravoslavnu crkvu. U pitanju je crkva Svetog Nikole, izgradjena 1902. godine, na temeljima crkve koja je bila izgrađena u XVII vijeku, ali je uništena u XIX vijeku. Crkva Sveti Nikola se gradila sve do 1909. godine, a njen projektant je bio poznati arhitekta Ćiril Iveković iz Sarajeva. Crkva je izgrađena u vizantijskom stilu, uz zidine starog grada.
Katedrala Sveti Tripun je jedan od simbola Kotora. Sveti Tripun je zastitnik grada. Katedrala svetog Tripuna je izgradjena 1166.godine, na mjestu gdje se nalazila crkva takođe posvećena sv. Tripunu, ali iz IX. vijeka. U jednom od prvih zemljotresa koji su pogodili Kotor,stara crkva je uništena, a na njenom mjestu, Kotorani su podigli katedralu i posvetili je svom zaštitniku. Kotorani vole da kažu da je katedrala dosta starija, od 1166. godine, što i jeste tačno, jer se danas unutar iste nalaze ostaci stare crkve.
Gospa od Zdravlja je katolička crkva, koja se nalazi na pola puta ka vrhu tvrđave San Đovani, tacnije na oko 650 stepenika, ispred koje se pruža divan pogled na grad. Crkva je sagrađena u XVII vijeku, nakon što je velika kuga, opuštosila Kotor. Prema legendi, na istom mjestu gdje se danas nalazi crkva Gospe od Zdravlja, se nalazio izvor vode. Kuga je već bila uzela maha, ljudima je trebalo nešto u sta ce vjerovati, kako bi se izliječili.
Crkva Sveta Ozana se nalazi na sjeveroistočnom dijelu gradskog jezgra Kotora, tačnije u jednoj od najdužih Kotorskih ulica, na trgu Blažene Ozane ili u poslednje vrijeme popularno nazvanom trgu od mačaka, zbog velikog broja mački koje se tu okupljaju poslednjih nekoliko godina. Jedan i po metar ispod nivoa sadašnje crkve, su pronađeni ostaci krstionice i crkvenog namječtaja, sto nam govori o tome, da se na istom mjestu, ranije nalazila takođe crkva.
